Goretzka mendapat tekanan pada kemenangan 2-1 hari Sabtu di Freiburg, yang membuat pemuncak klasemen unggul enam poin.
Pemindaian yang dilakukan pada hari Minggu mengonfirmasi cedera yang dialami pemain berusia 29 tahun itu.
Pemain internasional Jerman itu tertinggal di belakang Joao Palhinha dan Aleksandar Pavlovic dalam urutan kekuasaan di awal musim ini di tengah laporan bahwa ia akan meninggalkan klub.
Namun, dalam beberapa minggu terakhir, pemain Jerman yang telah 57 kali membela negaranya itu telah memanfaatkan cedera yang dialami Palhinha dan Pavlovic untuk memperkuat posisinya di starting XI.
Goretzka bergabung dengan Alphonso Davies dan Dayot Upamecano dalam daftar cedera Bayern yang terus bertambah. Bek tengah asal Jepang Hiroki Ito belum bermain untuk klub tersebut sejak bergabung pada musim panas setelah menjalani operasi kaki.
Begitu pemain Bayern Munich yang cedera kembali, pemain lain juga cedera. Itulah siklus yang terjadi di Bayern, dan tidak ada tanda-tanda akan berhenti.
Setelah kembalinya Josip Stanišić ke bangku cadangan di Liga Champions pada pertengahan minggu, Alphonso Davies cedera dan menghadapi masa pemulihan hingga dua bulan.
Stanišić kemudian kembali beraksi pada akhir pekan, tetapi hanya untuk menggantikan Leon Goretzka yang cedera.
Tanda-tanda positif sudah terlihat bagi manajer Vincent Kompany. Kembalinya Stanisic dan Joao Palhinha akan semakin meredakan kekhawatiran pemain Belgia itu di lini tengah, sehingga Goretzka punya cukup waktu untuk beristirahat dengan baik.
Setelah kekalahan mengejutkan di Eropa, kemenangan hari Sabtu sangat penting bagi Bayern. Pasukan Kompany harus berjuang keras untuk mengamankan tiga poin.
Meski kalah di tengah minggu, Kompany menambahkan bahwa para pemainnya berkomitmen terhadap tujuan musim ini, yakni memenangkan gelar.
“Setelah pertandingan seperti itu minggu lalu, saya senang dengan respons anak-anak. Ya, saya senang dengan kemenangan malam ini,” katanya.
Bayern memuncaki Bundesliga dengan 48 poin, sedangkan juara bertahan Bayer Leverkusen terpaut enam poin di posisi kedua.